Originalmente o seriado deveria ter um foco mais educativo, com mais episódios históricos, para as crianças aprenderem mais de história. Uma das coisas que o Diretor de Drama da BBC, Sidney Newman queria evitar eram os monstros esbugalhados e robôs. Após a gravação do primeiro episódio, ou “piloto”, foi tomada a decisão inédita de refazer a gravação (normalmente, se o piloto não é aprovado, o seriado é cancelado), e deixar o Doutor um pouco menos ríspido e mais amável.

As primeiras temporadas do Doutor Who duravam quase o ano todo, com mais de 40 episódios de 25 minutos por temporada, exibidos semanalmente, grande contraste em relação aos 13-14 episódios por ano atualmente transmitidos.

Filmado originalmente em branco e preto, vários episódios (incluíndo Marco Polo inteiro) foram destruídos pela BBC na década de 70. Incrivelmente, o primeiro piloto sobreviveu às limpezas do arquivo.

Uma Criança de Outro Mundo

Título Original: An Unearthly Child

4 episódios

Na primeira estória, composta de 4 episódios, somos apresentados à Susan e seu avô por dois professores da Susan, Ian Chesterton e Barbara Wright. Para tentar manter sua máquina de tempo espaço em segredo, ele resolve partir, levando junto os professores, que se tornarão companheiros nas viagens. Obviamente custam a acreditar que viajaram no tempo e voltaram para a Idade das Pedras, mas no final da estória passam a aceitar que o Doutor é um alienígena e que sua caixinha azul é uma sofisticada máquina do tempo e espaço.

Os Daleks

Título Original: The Daleks

7 episódios

O Doutor chega no planeta Skaro, e sabota a TARDIS para poder explorar o planeta. Mal sabe ele que será apresentado a o que se tornaria seu maior inimigo: os Daleks. Após uma longa guerra nuclear, os Daleks, sofrem mutação, sobrevivem dentro de “armaduras” blindadas. Além das mutações físicas, a mente dos Daleks também é alterada, sobrando apenas a vontade de exterminar todas as outras raças do universo. Com a ajuda dos pacíficos Thals, o Doutor, Susan, Ian e Barbara tentar vencer os Daleks e retornar à sua época.

À Beira da Destruição

Título Original: The Edge of Destruction

2 episódios

O Doutor ainda trata Ian e Barbara com suspeitas e reservas, e quando começam a acontecer coisas estranhas na TARDIS, logo suspeita dos 2. Ao final descobre-se que a TARDIS estava tentando voltar ao Big Bang devido a um curto na chave de “Retorno Rápido”. O Doutor passa então a confiar mais nos dois como companheiros de viagem.

Marco Polo

Título Original: Marco Polo

7 episódios

Desta estória resta pouco material, apenas o audio, que foi gravado por fãs na década de 60; e restaurado e lançado em CD pela BBC.

As Chaves de Marinus

Título Original: The Keys of Marinus

6 episódios

Os Aztecas

Título Original: The Aztecs

4 episódios

Os Sensorites

Título Original: The Sensorites

6 episódios

O Reino do Terror

Título Original: The Reign of Terror

6 episódios